A Universidade CEUMA possui atualmente uma infraestrutura moderna que comporta o desenvolvimento de pesquisas no Mestrado em Biologia Microbiana, graças à disponibilização de laboratórios exclusivos para a pesquisa. Contamos com biotério central, o qual foi totalmente reformado recentemente e inclui alas de criação, experimentação, quarentena e recuperação pós-cirúrgica. Os docentes do curso estão distribuídos nos laboratórios descritos abaixo. Além destes, a UNICEUMA conta ainda com uma estrutura de apoio, que inclui outros laboratórios vinculados aos cursos de Saúde (biomedicina, farmácia, nutrição e medicina), PPGs em Odontologia e Meio Ambiente.

1) Laboratório de Biologia Molecular de Microrganismos Patogênicos: Possui salas para: manipulação e cultivo microbiano; extração de biomoléculas; preparo de reagentes, amostras, e eletroforese; cultivo celular; manipulação de vírus; limpeza, e descarte de materiais. Equipamentos: 3 termocicladores, 2 equipamentos para eletroforese horizontal e vertical, transiluminador, equipamento para transferência de proteínas, 2 fontes para eletroforese, fotodocumentador de géis; espectrofotômetro, microcentrífuga refrigerada; Estufa de CO2, máquina de gelo, 3 freezers a -20ºC, freezer a -80ºC, 3 geladeiras, forno de micro-ondas; capela de fluxo laminar Classe II A1, balança analítica, incubadora B.O.D., bicos de Bunsen com gás encanado, jarras de anaerobiose, autoclave vertical, banho-maria com agitação, microscópio óptico, microscópio invertido, estufa de secagem, pHmetro, agitador magnético, vórtex, microscópio de campo claro; banho-maria termostático; autoclaves, 3 refrigeradores, estufa bacteriológica, balança analítica, 3 bicos de bunsen.

2) Laboratório de Imunologia das Doenças Parasitárias e Infecciosas: Possui salas para: cultivo celular, ensaios imunoenzimáticos e citometria de fluxo, preparo e descontaminação de materiais. Equipamentos: citômetro de fluxo (BD Accuri), fluorímetro/luminômetro, centrífuga não-refrigerada, 2 centrífugas refrigeradas (microplacas, microtubos e tubos de 15 e 50 mL), 3 geladeiras, 2 freezers (-20ºC), freezer -80ºC, fluxo laminar Classe II A1, microscópio óptico, cabine refrigerada tipo adega, estufa microbiológica, estufa CO2.

3) Laboratório de Microbiologia Ambiental: Possui salas para: preparo de materiais, manipulação e cultivo microbiano, revelação de ensaios blot; limpeza e autoclavagem. Equipamentos: capela de fluxo laminar Classe II A1, pHmetro, 2 microscópios de luz, 2 microscópios estéreos, estufa de secagem, autoclave vertical, agitador orbital para vidrarias com temperatura controlável, deonizador de água, estufa microbiológica, 2 geladeiras, freezer a -20ºC, balança analítica, 7 bicos de Bunsen com gás encanado.

4) Laboratório de Microbiologia Aplicada: Possui salas para: preparo de materiais, manipulação e cultivo de microrganismos, PCR, e autoclavagem. Equipamentos: capela de fluxo laminar Classe II A1, pHmetro, microscópio de luz, banho-maria com circulação, estufa de secagem, autoclave vertical, estufas microbiológicas, 4 geladeiras, 2 freezer (-20ºC), 2 balanças analítica, 8 bicos de Bunsen com gás encanado.

5) Laboratório de Microscopia: Abriga o microscópio para campo claro, contraste de fase e fluorescência (Axio Imager Z2).

6) Sala de Equipamentos Multiusuários: Salas para trituração de tecidos e extração de ácidos nucléicos, quantificação de biomoléculas e PCR em tempo real. Equipamentos: termociclador Quantstudiotm 6 Flex Real-Time PCR System, sistema de purificação automatizado de biomoléculas (Qiacube), homogeneizador de tecidos (TissueLyser), espectrofotômetro Nanodrop.

7) Laboratório de Microbiologia das Infecções Respiratórias Agudas e Produtos naturais: Possui salas para: manipulação de microrganismos, cultivo celular, ensaios in vitro e imunoenzimáticos. Equipamentos: sonicador ultrassônico, incubadora "shaker", microcentrífuga refrigerada, cabines de segurança biológica classe II A1, centrífuga para tubos e placas, banho-maria, vórtex, citocentrífuga, 2 geladeiras, freezer, leitor de microplacas, microscópio óptico, estufa de secagem, balança analítica.

8) Biotério central: Composto por setores de criação, manutenção, experimentação e recuperação todos com exaustores de ar, controle de temperatura, controle de ciclo claro/escuro (12h/12h), além de setores para paramentação, lavagem, autoclavagem de material cirúrgico e descontaminação e congelamento de carcaças. Os setores de criação e manutenção possuem 3 racks ALESCO para 105 microisoladores, estantes e gaiolas. Apresenta ainda, sala de estoque de ração, balanças e capela de fluxo laminar.