Análise in silico do DNA genômico de três espécies do gênero Candida para verificação de ocorrência de microssatélites e observação de semelhanças interespecíficas

Letícia Vieira Barbosa, Iven Neylla Farias Vale Mendes, Marcia Barros Alves, Bruno Carvalho Campelo, Karol Cristina Fonseca Moura, Naiza Maria Castro Nogueira, Cristina de Andrade Monteiro

Resumo


Nos últimos anos, estudos epidemiológicos apontam a contribuição relevante que fungos do gênero Candida, especialmente Candida albicans, vêm dando às infecções hospitalares e comunitárias, seguidas de altas taxas de morbidade e mortalidade, principalmente de lactentes e pacientes imunocomprometidos. Os protocolos comumente conhecidos para análise e identificação das espécies são muito caros e demorados e, por isso, estudos in silico dos microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeat) se tornaram importantes marcadores moleculares proporcionando à engenharia genética uma estratégia para ligar variações do genótipo às variações fenotípicas sem a utilização de métodos caros e demorados de análise. O presente trabalho avaliou a presença de SSR em sequências de DNA de diferentes espécies de Candida depositadas no GenBank a fim de detectar possíveis diferenças entre elas através de programas específicos. Em Candida albicans foram identificados maior número de SSR além de maior variedade de motivos (repetições). Foi detectado um número reduzido de microssatélites em C. tropicalis (cinco) e nenhum foi encontrado em C. parapsilosis. A utilização de SSR como ferramenta de identificação de Candida foi considerada satisfatória, pois revelou importantes diferenças entre as espécies analisadas quanto a presença e os tipos de SSR.

Palavras-chave: Candida, microssatélite, SSR, Candidíase

 


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DOI: https://doi.org/10.24863/rib.v9i1.82

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